Al crear la diócesis de Tlaxcala, el papa Juan XXIII ordenaba al nuevo Obispo que “funde un seminario, al menos para la etapa elemental, para recibir a los jóvenes llamados al sacerdocio” (Seminarium saltem elementarium condat, pueris excipiendis ad sacerdotii munus vocatis). Cfr. Bula Cristianorum gregem, 23 mayo de 1958, AAS 51 [1959].

Una vez establecida la nueva Iglesia particular, Mons. Luis Munive y Escobar, expresó como una de sus primeras preocupaciones la creación del seminario. Así con la ayuda de sacerdotes, religiosos (as) e instituciones como Adveniat, promovió la construcción del “corazón de la Diócesis”.